La commune compte une centaine de grottes ornées, dont lagrotte à la Peinture remontant au mésolithique. De nouvelles fouilles sont en cours depuis octobre 2020… A cette occasion, le monolithe de la grotte à la Peinture a été transporté à la salle Sablonnière du village.

Le site est un lieu mystique qui a inspiré pendant des siècles la foi des hommes et des femmes qui l’habitaient, avant même d’être un haut lieu de la spiritualité chrétienne. Il existait certainement sur ce site dans la Gaule, un sanctuaire dédié au culte de l’eau.

On peut dater la destruction et l’abandon du sanctuaire de Larchant entre 350 et 378. Les autres sanctuaires proches de Larchant (Sceaux du Gâtinais, Pithiviers-le-Vieil, Châteaubleau) ont été détruits à peu près à la même époque.

Un habitat du premier âge du fer a été repéré en 2005 non loin du hameau de Bonnevault.